人类文明进入动乱的时代,地球笼罩在战火之下,各大主要城市相继沦陷,人类四散而逃,血流成河。虽然星野铁郎(野沢雅子 配音)破坏了机械化星球,但是机器人与人类的战争仍在继续,并且人类已经到了生死存亡的危急时刻。正值紧要关头,铁郎得到来自梅蒂尔(池田昌子 配音)的信息,要他重新搭乘银河铁道999号。在一众战友的帮助下,铁郎穿过一道道火线,经过几番周折,终于登上了久违的银河铁道999号,重新开始了一段漫长、孤独而又充满惊险的宇宙旅程……新闻上直播的正是狮将军府里的狼藉现场,一个现场女记者正在对着镜头解说这里发生了什么事,其中几次提到刹人者是一个具有天眼的风系帝级男子,还说据了解,目前整个珈蓝星只有元帅府下一个叫陈源的年轻供奉具有帝级的修为。